Pode ser que as verificações update-grub2 não consigam ler uma partição BTRFS. Em teoria, eles devem funcionar se você montá-lo, mas o grub deve ser executado antes que qualquer um dos drivers do sistema de arquivos seja carregado, por isso talvez faça sentido não ter escolhido essa partição em particular.
Eu tive alguns problemas semelhantes com partições formatadas XFS também. Parece grub apenas como FAT / EXT / NTFS. Para outras coisas, sempre tive que editar manualmente o menu do grub.
BTW, eu prefiro usar o Grub Customizer para editar o arquivo de configuração do grub em um editor de texto. Embora não esteja disponível nos repositórios normais, eu tenho que adicionar um ppa do launchpad para instalar esta ferramenta: link