Supondo que você não queira o espaço adicional de uma pasta de backup criptografada usando apenas o eCryptfs, convém examinar o CryFS .
Parece ser projetado com o armazenamento em nuvem em mente, tentando ocultar todos os arquivos & amp; metadados do diretório. Parece similar ao pegar um contêiner LUKS e armazenar cada bloco individual como um arquivo (mas provavelmente usando aglomerados de blocos, para evitar milhões de 512 bytes).
Está no Debian ( Stretch / Stable [9], Buster / Testing [10], Sid) & amp; repositórios do Ubuntu (Zesty [17.04], Artful [17.10] e Bionic [18.04]), enquanto sua página da web tem downloads para algumas versões mais antigas.
Eu não tenho 100% de certeza se ele suporta a visão --reverse
do EncFS que você parece estar indiretamente procurando, mas o software que eu encontrei para o linux tudo faz uma cópia local dos arquivos da nuvem, então novamente você Teria uma pasta "backup" criptografada.