O que você poderia fazer é criar seu userscript e criar um link simbólico para /usr/share/unity-webapps/userscripts/unity-webapps-$NAME/$NAME.user.js
:
( $MYSCRIPTPATH
é o caminho completo para o seu script, provavelmente em algum lugar em seu diretório pessoal; $NAME
é o nome do seu script)
sudo mkdir /usr/share/unity-webapps/userscripts/unity-webapps-$NAME
sudo ln -s $MYSCRIPTPATH /usr/share/unity-webapps/userscripts/unity-webapps-$NAME/$NAME.user.js
Você também precisará criar manualmente um arquivo de manifesto em /usr/share/unity-webapps/userscripts/unity-webapps-$NAME/manifest.json
- basta copiar um dos outros aplicativos no userscripts
dir e modificar os valores de acordo com seu webapp.