Esse problema exato me deixou louco. A solução é aplicar as configurações gráficas em mais de um menu de opções. Primeiro, você deve aplicar as configurações no menu de configurações da nvidia e, em seguida, abrir o menu Exibir (localizado no menu Todas as configurações) e clicar em Aplicar também. Eu sei que você não está ajustando nenhuma configuração no menu Displays, mas você deve clicar em aplicar lá de qualquer maneira, para que suas configurações nvidia persistam entre as reinicializações.