Com unidades de inicialização USB tipo Syslinux , como MultiBootUSB, MultiBoot USB, Unetbootin, etc., geralmente existe uma opção no menu de inicialização para inicializar o primeiro disco rígido.
Com unidades de inicialização USB do tipo Grub2, como o mkusb e o MultiBootUSB original, um menuentry para inicializar uma unidade interna pode ser adicionado ao grub.cfg do USB, localizado na partição usbboot:
menuentry 'Ubuntu 16.04.2 LTS (16.04) (on /dev/sdxy)' {
insmod part_msdos
search --no-floppy --fs-uuid --set=root uuuu-uuuu-iiii-dddd
linux /boot/vmlinuz-4.4.0-87-generic root=UUID=uuuu-uuuu-iiii-dddd ro quiet splash
initrd /boot/initrd.img-4.4.0-87-generic
}
Se o Windows é o sistema operacional na unidade interna, está além do escopo desta resposta.
Com uma unidade de inicialização USB de instalação completa , abra o terminal e execute:
sudo update-grub
e ele adicionará qualquer sistema operacional nas outras unidades do seu computador, incluindo o Windows.