Coloque a partição casper-rw ext4 primeiro (torne-a a primeira partição na unidade). Você precisa de um parâmetro persistente em ambos os menus (syslinux.cfg para inicialização do MBR e grub.cfg para inicialização via UEFI). O Unetbootin não suporta a inicialização via UEFI, portanto, não se preocupa em alterar o arquivo.