Existem basicamente duas opções:
Não use ambientes de área de trabalho ou aplicativos que dependam do GVFS
Isso exclui a maioria dos softwares baseados no GNOME, mas não os softwares baseados apenas no kit de ferramentas GTK +. Você pode experimentar o LXDE como um ambiente de desktop e suíte de software, pois ele tenta ser leve e não depender de bibliotecas úteis, mas não cruciais, como o GVFS.
Use criptografia total de disco
Se você realmente quiser ter certeza de que nenhum (meta) dados vaza em regiões não criptografadas, a única maneira de ter certeza é criptografando tudo .
Se você estiver menos preocupado, poderá achar a criptografia do diretório pessoal do usuário suficiente. Alternativamente, você pode configurar uma área criptografada dentro do seu diretório home e mover e sym-link .local/share/gvfs-metadata
there.