Parece que o agente de autenticação do kit de políticas não foi iniciado no programa de aplicativos de inicialização.
Adicione a linha abaixo aos aplicativos de inicialização.
/usr/lib/policykit-1-gnome/polkit-gnome-authentication-agent-1
Observe também que isso já foi levantado como um bug e fixo é fornecido no software-center - 5.3.9
Atualize seu centro de software para corrigir o problema.
Aqui estão os detalhes do bug