No Ubuntu, quaisquer aplicativos em execução (ou melhor, suas janelas (principais?)) são geralmente mostrados em pelo menos dois lugares (por favor, desculpe a terminologia possivelmente incorreta - sinta-se livre para inserir os termos reais via edições):
Desde muito recentemente (possivelmente, mas não definitivamente desde a atualização para o Ubuntu 17.04 há alguns dias?), nada disso acontece mais em algumas aplicações. Seus ícones simplesmente não aparecerão nos lugares descritos.
Em particular, noto isso ao lançar o MonoDevelop - o aplicativo funciona bem, mas não consigo voltar para ele depois que ele estiver em o fundo, além de minimizar / redimensionar as outras janelas.
Existe alguma maneira de "recuperar / redefinir" a "barra de tarefas" e "alternador" para que recarregue a lista de aplicativos em execução? É claro que uma reinicialização do sistema pode fazer, mas como sempre, é um incômodo fazer isso quando percebo o problema no meio do meu trabalho.