Eu tive um problema semelhante com um Dell R730 não permitindo que um sistema operacional fosse carregado quando uma placa PCIE estava conectada. Se a placa PCIE não estivesse conectada, eu poderia carregar o sistema operacional sem problemas. Depois, liguei o cartão de volta e funcionou sem problema.
No entanto, descobri que na verdade era um problema de BIOS nos servidores da Dell. Voltei ao BIOS 1.2.10 a partir de abril de 2015 e o sistema permitiu que eu carregasse um sistema operacional com a placa PCIE conectada sem problemas. Eu também tinha tentado 2.0.2 a partir de abril de 2016, e ainda tinha o mesmo problema, então algum tempo depois de 1.2.10, a Dell mudou seu BIOS e causou esse problema.