Você não parece ter mpm_itk.load em sua pasta mods, o que provavelmente indica que não está carregado.
sudo a2enmod mpm_itk
sudo service apache2 restart
Como eu estava atualizando para o Ubuntu 16.04, notei que ele removeu libapache-mpm-itk . Após a atualização, eu corri apache2ctl configtest para ver se ele passaria.
O primeiro erro que eu encontrei "não pode carregar libphp5.so" e então eu purgei e instalei a libphp, que instalou o php7. Até aí tudo bem.
O próximo erro foi esperado:
AH00526: Syntax error on line 4 of /etc/apache2/sites-enabled/nsc.local.conf: Invalid command 'AssignUserID', perhaps misspelled or defined by a module not included in the server configuration
Note que eu usei com sucesso o mpm antes de atualizar.
Então, a próxima coisa lógica a fazer é instalar o Apache 2 ITK MPM:
sudo apt-get update && sudo apt-get install libapache2-mpm-itk
mas ... isso não mudou nada. Ainda obtenho o mesmo erro. Alguma idéia de onde ir a partir daqui?
Informação da FYI:
$ apache2 -v
Server version: Apache/2.4.18 (Ubuntu)
Server built: 2016-07-14T12:32:26
$ sudo apt-get update && sudo apt-get install libapache2-mpm-itk
Get:1 http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security InRelease [102 kB]
Hit:2 http://us.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial InRelease
Hit:3 http://us.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates InRelease
Get:4 http://us.archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-backports InRelease [102 kB]
Fetched 204 kB in 0s (373 kB/s)
Reading package lists... Done
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
libapache2-mpm-itk is already the newest version (2.4.7-04-1).
0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded.
$ ls /etc/apache2/mods-enabled/
access_compat.load autoindex.load mpm_prefork.conf proxy.load
alias.conf deflate.conf mpm_prefork.load rewrite.load
alias.load deflate.load negotiation.conf setenvif.conf
auth_basic.load dir.conf negotiation.load setenvif.load
authn_core.load dir.load php7.0.conf socache_shmcb.load
authn_file.load env.load php7.0.load ssl.conf
authz_core.load filter.load proxy.conf ssl.load
authz_host.load headers.load proxy_html.conf status.conf
authz_user.load mime.conf proxy_html.load status.load
autoindex.conf mime.load proxy_http.load xml2enc.load
Você não parece ter mpm_itk.load em sua pasta mods, o que provavelmente indica que não está carregado.
sudo a2enmod mpm_itk
sudo service apache2 restart