Você mencionou que verificou a tela de opções de energia, por isso, adicionarei essa, mesmo que não ache que esteja afetando você, mas que você pode verificar, no entanto:
A única coisa em que consigo pensar agora são as configurações do gnome que você pode usar através do terminal:
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.power sleep-inactive-ac-timeout 0
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.power sleep-inactive-ac-type nothing
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.power sleep-inactive-battery-timeout 0
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.power sleep-inactive-battery-type nothing
O valor de 0 segundos nas linhas 1 e 3 desativa a função. O recurso nothing nas linhas 2 e 4 é como bater um martelo duas vezes.
Se o problema persistir, há outras coisas em systemd para ver como xautolock , mas as etapas acima são as mais óbvias para tentar primeiro.