Você parece estar um pouco confuso. Não existe uma única coisa que seja conhecida como "linux". Existem muitas versões do linux, como abençoadas por Linus Torvalds, e então há muitas versões ligeiramente diferentes disso, empregadas por diferentes fornecedores. Qualquer que seja o kernel em que uma determinada máquina host esteja rodando é o único kernel naquele sistema em particular, e é compartilhado por todos os contêineres rodando naquela máquina, mas isso não quer dizer que é exatamente o mesmo kernel rodando em outra máquina.