Não, isso não é possível: o aplicativo de telefone padrão usa tecnologia de 25 anos de idade com largura de banda muito baixa e não é adequado para criptografia. (9600 BAUD é muito pouco para adicionar criptografia)
Desculpe! : - (
Dito isto: nada é verdadeiramente impossível , mas aplicar criptografia criptográfica moderna a um sistema que tenha uma largura de banda baixa exigiria muito processamento energia do telefone em si, de modo que ninguém se incomodou em fazer isso: existem outras maneiras de fazer chamadas criptografadas por aí ...