Parece que resolvi o problema. Eu instalei
apt-get install gnome-setting-deamon
e agora tudo funciona muito bem!
Como @ 9a3eedi viu, esta não é a solução, pois mate é mate-setting-deamon
do pacote.Eu deletei gnome-setting-deamon
e o pc funcionou da mesma maneira.
Então eu não sei a solução e porque eu tenho esse problema.