Se você conseguiu fazer login e ver seu papel de parede e talvez itens em sua área de trabalho, tente clicar com o botão direito em uma área vazia e escolha Abrir no terminal no menu de contexto.
Uma janela sem decorações surgirá. Agora digite o seguinte:
cd
cd .cache
mv compizconfig-1 compizconfig-1-old
pkill -u $USER
O último comando irá matar sua sessão e deixá-lo de volta à tela de login. As alternativas ao comando pkill estão indo para um terminal pressionando CTRL + ALT + F1 e então CTRL + < kbd> ALT + DELETE e a máquina será reinicializada.
Quando você tiver uma tela de login, faça o login e aproveite o menu de unidade e a barra superior com os miniaplicativos.
Especulações sobre por que isso acontece
Ao olhar para o meu /var/log/apt/term.log notei muitos pacotes de compiz sendo atualizados antes que isso acontecesse. Isso afeta apenas o meu usuário e nunca minha esposa, então eu acho que é porque eu faço algumas personalizações nas preferências, e até mesmo o ubuntu-tweak, enquanto minha esposa não faz isso.