Eu não acho que é esse comando que faz a sua máquina lenta - o grub-probe apenas detecta valores de informações simples de um disco ou partição.
Você pode se aprofundar no que está acontecendo sabendo quem o chamou quando o viu na lista de processos. Faça um
ps auxf
para obter uma saída tree'ish e encontrar o processo pai no grub-probe.
Você também pode verificar seu diretório etc para quaisquer chamadas para esse programa
sudo find /etc -type f -exec grep grub-probe {} \;
Isso deve fornecer uma lista de arquivos que contenham a sequência grub-probe. Examinar o arquivo e onde ele é usado pode dar a resposta.