Lembre-se de que suas permissões precisarão ser as mesmas. Além do symlink, em distros e sistemas de arquivos mais recentes, como root você também pode usar o bind-mount:
mkdir /home/username
mount --bind --verbose /extra-home/username /home/username
Isto é útil para permitir o acesso "através" do diretório / home aos subdiretórios através de daemons que são configurados para evitar pathing através de links simbólicos (apache, ftpd, etc.).
Você precisa se lembrar (ou script de inicialização) para vincular-se a reinicializações, é claro.