Este é um problema comum com o Skype, eu tive também. Para consertar isso, você precisa instalar as configurações do sistema do kde (infelizmente, nenhuma opção para o cursor no qt-config, e provavelmente não é tão trivial, ou sábio editar manualmente o qt-config). Nas configurações do sistema do KDE, escolha a opção do mouse para alterar o tema do cursor do Qt.
Outra possível correção é alterar o tema padrão para todo o seu sistema. Execute galternatives e altere o tema do cursor x para o que você usa atualmente.