1. Fontes
Eu procurei um pouco sobre essa questão, mas não encontrei uma maneira de tornar as fontes "mais ousadas". A questão não parece ser específica do Ubuntu 13.10 no entanto. O link que você se refere é sobre outro bug, que realmente torna o texto um pouco mais grosso. (veja abaixo)
Eu encontrei algumas coisas que podem ajudar você, eu não sei se você vai encontrá-las melhor, sinta-se à vontade para experimentá-las.
Faça uso de fontes do sistema no menu e em outros lugares
Esse bug na verdade torna muito mais agradável o texto na minha opinião . Apenas sudo apt-get install fonts-unfonts-core
e reinicie o netbeans. (só funciona com o JDK7) Vai ficar assim:
Noentanto,issonãoalteraafontedoeditor.
Alterartema
Aalteraçãodotemaalteraumpoucoasfontes,masnãoastornamaisespessas.
gedit~/netbeans-7.4/etc/netbeans.conf
Adicione--lafMetal
aonetbeans_default_options
Otemapadrãoé"GTK". Eu gosto de "Metal" eu mesmo. você pode encontrar uma lista completa de temas no site do netbeans
Outrasopções
Eunãotenteipormimmesmo,mas
2. Estouro
Eu não entendo o que você quer dizer. Talvez uma captura de tela ajudaria?
3. Janelas estranhas que têm tamanho errado, sombreamento errado
Parece ser um bug no java. Se eu uso o JDK6, é bem pior ...