Eu tive um problema muito parecido com o servidor ubuntu 17.04 e um LSI 9240-8i. Descobri que eu tinha instalado o Ubuntu no modo UEFI, mas minha placa-mãe estava tentando carregar o firmware do BIOS do controlador. Eu recebi exatamente o mesmo resultado do dmesg descrito na questão.
Resolvi o problema alterando meu BIOS para preferir o firmware UEFI de dispositivos PCI-E.
Depois disso, os drivers do ubuntu foram carregados corretamente e meus discos estavam disponíveis no sistema operacional.
Alterar minhas configurações da BIOS também desabilita a GUI RAID que pode ser carregada durante a inicialização, mas eu não precisava disso desde que eu já tinha definido minha configuração.