Duas coisas para verificar aqui: (isso é do Como instalar o Ubuntu no Nexus Guide )
Primeiramente, você ativou seu nexus no modo de desenvolvedor e ativou a depuração USB.
Após ativar o Modo de desenvolvedor, o item de opções do desenvolvedor é exposto na página "Configurações".
Navegue até Configurações → Opções do desenvolvedor Ativar o USB depuração. Quando um dispositivo é conectado, você será solicitado no Android para autorizá-lo.
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Conecte fisicamente seu dispositivo habilitado ao seu desktop Ubuntu via USB.
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No Android, aceite o aviso para Permitir depuração USB no computador especificado.
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Para verificar a conexão, use adb para exibir dispositivos conectados no momento:
Em seguida, no terminal:
dispositivos $ adb
Isso deve mostrar seu dispositivo
Em segundo lugar, você precisa se lembrar de reiniciar o dispositivo no modo de bootloader novamente no terminal:
bootloader adb reboot
Em seguida, execute novamente o comando ubuntu-device-flash - que você fez anteriormente
Eu realmente recomendo a leitura do guia wiki para garantir que você esteja seguindo a metodologia correta
Eu também recomendo que você leia o novo guia e a ferramenta desenvolvida por Marius Quabeck, que é muito mais fácil:
link