Eu tive exatamente o mesmo problema, consegui corrigir esse bug fazendo o seguinte:
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Garantir que meu sistema está atualizado
sudo apt-get update
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desinstalou tudo relacionado ao inkscape, o PPA's está incluído.
- baixei o pacote Inkscape para o Ubuntu 16.04 do pkgs.org/download/inkscape
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instalou o pacote do teminal usando o gdebi, se você não tem ele instale ele
sudo apt-get install gdebi
então
sudo gdebi inkscape_0.91-7ubuntu2_amd64.deb
NOTA: verifique se o diretório no terminal é o mesmo em que você baixou o pacote .deb ou receberá uma mensagem "arquivo não encontrado".
Corre bem agora.
Todo o crédito para corrigir esse bug vai para @rancho, pois todos os detalhes sobre como ele ajudou você podem seguir este link: dependências não atendidas após a atualização para 16.04.1
Espero que também corrija o bug para você.