Não.
- você precisa fazer backup deles para salvá-los (sempre faça isso). Não é necessário removê-los.
- Você instala o Ubuntu em um espaço não alocado, a menos que queira remover o sistema operacional atual. Se o primeiro o seu sistema Windows vai estar lá como dual boot após a instalação termina. Se o último Ubuntu remover seus arquivos para você e remover TODAS as partições relacionadas ao sistema operacional (que seria C: D: E: F: ou qualquer outra letra relacionada a esse sistema).