Você pode criar um crontab para o usuário específico assim:
crontab -u <username> -e
Ou, mais simplesmente, você poderia simplesmente executar crontab -e
quando efetuado login como esse usuário.
Como alternativa, você poderia prefixar seu comando em seu crontab (root) com sudo -u <username>
para executar o comando como o usuário especificado.