/etc/init.d era a árvore antiga para configurações de serviço usadas com o sysVinit. upstart manteve alguma compatibilidade com versões anteriores e usou uma entrada em etc/init para invocar esses serviços não (ainda) convertidos para upstart .
Desde a introdução de systemd , essas entradas parecem estar completamente obsoletas.
Veja também o link .