Antes de tudo, você deseja configurar Master Replication Slave no MySQL. Todos os passos estão claramente explicados em este site .
Em seguida, você precisa criar um shell scripts que contenha a conexão mysql e os comandos para iniciar / parar a replicação.
STOP SLAVE;
START SLAVE;
Por fim, você precisa configurar um cron job para executar os scripts shell similares a este.
# Minute Hour Day of Month Month Day of Week Command
# (0-59) (0-23) (1-31) (1-12) (0-6)
0 0 * * 1 sh shell_script.sh