Não há nada de especial nisso.
Ao instalar, se as unidades antigas ainda estiverem conectadas ao computador, você deverá selecionar "alguma outra coisa" como o método de instalação, em vez das outras opções para garantir que o Ubuntu esteja instalado na unidade correta. Então você terá que configurar as partições você mesmo (efi (se necessário), swap, /, / home (se desejado separado)). Por favor me diga se você precisar de ajuda com isso.