Não sei como você conseguiu a listagem de tamanho depois de executar rsync , mas caso tenha usado du , lembre-se de que du não conta tamanhos para links físicos duas vezes. De sua página de manual:
-l, --count-links
count sizes many times if hard linked
Em outras palavras, a menos que você passe o sinal -l , você não poderá contar os tamanhos dos arquivos com link físico em ambos os locais.
Para tentar resolver suas dúvidas:
- Você está ligando muito entre www e test. Então, sim, se você fizer mudanças no teste, você as verá refletidas em www. Parece que você não quer links strongs, da sua pergunta.
- Você quer economizar espaço, o que é bom, mas você não pode a) economizar espaço e ter apenas uma cópia dos arquivos, enquanto b) simultaneamente ter os arquivos em teste e www ter conteúdo diferente. Apenas não é possível!
Se você quiser que os diretórios test e www tenham o mesmo conteúdo, mas faça as alterações, você pode executar o comando rsync , não usar --hard-links e não usar --link-dest .