Para corrigir seu primeiro problema, execute isso em um terminal:
sudo rm /etc/apt/sources.list.d/*.disable
(Uma versão mais antiga da ferramenta de gerenciamento de pacotes deixou esses arquivos quando você desabilitou os PPAs. Removê-los é bastante seguro)
Seu segundo problema vem do antigo repositório Karmic. Para descobrir qual deles executa isso em um terminal:
cd /etc/apt
grep -rw karmic *
Quando você souber de qual repositório ele vem, será fácil desativá-lo / removê-lo.