Estou prestes a começar a chorar agora, já que não consigo entrar em contato com vocês. Meu problema é sobre a instalação de gromacs 4.6.1, segui exatamente o que foi dito em link eu segui com sucesso até o último, mas quando eu digitei grompp, ele mostrou um erro como Program grompp, VERSION 4.6.1 Arquivo de código fonte: /home/roshan2004/Downloads/gromacs-4.6.1/ src / gmxlib / futil.c, linha: 593
Erro de entrada / saída de arquivo: grompp.mdp Para obter mais informações e dicas para solução de problemas, consulte o site da GROMACS em link com algumas informações sobre gromacs acima, quando eu digitei que mdrun Program mdrun, VERSION 4.6.1 Arquivo de código-fonte: /home/roshan2004/Downloads/gromacs-4.6.1/src/gmxlib/gmxfio.c, linha: 524
Não é possível abrir o arquivo: topol.tpr Para obter mais informações e dicas para solução de problemas, consulte o site da GROMACS no link Então, claramente, existem alguns erros, agora, como consertar isso? ** Eu até tentei instalar usando o sudo apt-get install gromacs, mas quando eu digitei o mdrun, ele deu o mesmo problema que o anterior - Não consigo abrir o arquivo: topol.tpr ** Mesmo depois de instalar via sudo apt, me deu o seguinte problema: / usr / bin / mdrun roshan2004 @ ubuntu: ~ $ mdrun GROMACS: gmx mdrun, VERSÃO 5.0.2
O GROMACS é escrito por:
Emile Apol Rossen Apostolov Herman JC Berendsen Par Bjelkmar
Aldert van Buuren Rudi van Drunen Anton Feenstra Sebastian Fritsch
Gerrit Groenhof Christoph Junghans Peter Kasson Carsten Kutzner
Per Larsson Justin A. Lemkul Magnus Lundborg Pieter Meulenhoff
Erik Marklund Teemu Murtola Szilard Pall Lixadeira Pronk Review
Roland Schulz Alexey Shvetsov Michael Camisas Alfons Sijbers
Peter Tieleman Christian Wennberg Maarten Lobo
e os líderes do projeto:
Mark Abraham, Berk Hess, Erik Lindahl e David van der Spoel
Copyright (c) 1991-2000, Universidade de Groningen, Holanda. Copyright (c) 2001-2014, A equipe de desenvolvimento do GROMACS em Universidade de Uppsala, Universidade de Estocolmo e o Instituto Real de Tecnologia, na Suécia. confira link para mais informações.
O GROMACS é um software livre; você pode redistribuí-lo e / ou modificá-lo sob os termos da Licença Pública Geral Menor GNU conforme publicado pela Free Software Foundation; qualquer uma das versões 2.1 da Licença, ou (a seu critério) qualquer versão posterior.
GROMACS: gmx mdrun, VERSÃO 5.0.2 Executável: / usr / bin / gmx Biblioteca dir: / usr / share / gromacs / top Linha de comando: mdrun
Recuar! Acabei de fazer o backup de md.log para ./# md.log.2 #
Programar mdrun, VERSÃO 5.0.2 Arquivo de código-fonte: /build/buildd/gromacs-5.0.2/src/gromacs/fileio/gmxfio.c, linha: 513
Não é possível abrir o arquivo: topol.tpr Para obter mais informações e dicas para solução de problemas, verifique o GROMACS website em link