Eu tenho que saber se isso pode ser um problema X / Y. Que problema você está tentando resolver? Você certamente pode ter dois pen drives em um computador, inicializar a partir de um e salvar dados no outro. Por padrão, você deve ver o USB sem inicialização abaixo de Computador, no lado esquerdo das janelas Arquivos.
Para sua segunda pergunta, duvido que algo assim seja possível e, novamente, não entendo por que você gostaria de fazer isso.