O grande problema que estou tendo é semelhante, o tempo limite padrão de comissionamento está definido para 10 minutos. Em teoria, ANTES de rodar o comando "juju bootstrap", você pode alterar este "bootstrap-timeout" para algo como 1800 (30 minutos), mas isso não parece ser configurável depois de executar o comando bootstrap.
Os documentos sugerem que você pode apenas editar o arquivo environments.yaml e ele irá aderir à sua sugestão de atualização, mas eu não estou vendo que isso realmente aconteça.