Normalmente, reiniciar a unidade ajuda. Você pode fazer isso Alt + F2 e depois digitar:
unity --replace
Nota: não execute este comando em um terminal, caso contrário a unidade será eliminada quando o terminal for fechado.
Isso obviamente não é uma correção. Apenas uma maneira de desfazer o erro depois que ele ocorrer. Suponho que esses erros (e os postados em meus comentários à sua pergunta) serão corrigidos com atualizações futuras. Existem muitos relatórios de bugs no launchpad referentes a eles.
Você também pode tentar e instalar Gerenciador de Configurações do CompizConfig / sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
e joga com a configuração lá. Pode ou não ajudar - dependendo de quem você pergunta.