Então, tive esse problema muito, especialmente ao tentar desenvolver usando o Bluefish IDE, e as caixas cinzas estão no meu espaço de trabalho, o que o torna um incômodo extremo.
Quando esse problema ocorre em uma janela menor, as caixas cinzas cobrem quase tudo.
Aqui está um pequeno exemplo:
Espero que vocês saibam qual é o problema e espero que você saiba como corrigi-lo.
(Se você olhar na parte do editor de texto do IDE, verá as caixas cinzas sobre a área de texto em branco.
Eu tenho um processador Intel usando gráficos HD 4400.