Você deve usar o ffmpeg, veja
link
Mas, neste momento, parece que você só pode definir uma tag de título ou um áudio resp. fluxo de vídeo uma tag de idioma
Mas se o nome do arquivo de destino na linha de comando terminar com .mkv em vez de .webm, você poderá definir mais metadados, como a tag de descrição. Mas então você tem um contêiner matroska.
Uma chamada de exemplo é:
ffmpeg -i tr3d.webm -c copy -metadata title="Moin Moin" -metadata license="CC-BY-NC-ND" -metadata description="Eine Fahrt im TR 09" -metadata copyright="Michael Dittmer" -metadata genre="Documentation" -metadata date_released="2014" -metadata url="http://www.pro-transrapid.org" -metadata artist="GFM-eV" -metadata publisher="Pro-Transrapid" -metadata:s:a:0 language="Spanish" tr3d_tagged.mkv