Permissões erradas, o servidor é executado como mysql
. Corrigir com:
sudo chown -R mysql:mysql /var/lib/mysql/databasename
exemplo:
% top -u mysql
PID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND
15891 mysql 20 0 4472 1684 1536 S 0,0 0,0 0:00.00 mysqld_safe
16240 mysql 20 0 728684 117020 12068 S 0,0 2,9 0:00.38 mysqld