Tenho uma sugestão, mas não sei se vai resolver o problema ou não.
Tente iniciar novamente no Ubuntu e veja se os discos estão aparecendo. Se não, tente ver se eles estão pelo menos visíveis no Utilitário de Disco ou no GParted. Se estiverem, em seguida, no Utilitário de Disco, basta clicar nos dados SMART e depois em Executar autoteste. Se algum erro for relatado, ele pode estar impedindo que o disco seja montado.
Depois disso, tente inicializar no Windows e apenas verificar os discos NTFS ( Clique com o botão direito - > propriedades - > tools- > check ). Você pode querer começar com o cheque mais vigoroso. Então eu sugiro que você faça isso:
clique direito em iniciar (ou pressione win + X) - > Escolha Prompt de comando (Admin) - > Digite o seguinte:
chkdsk /B D:\
Substitua D: \ pelas letras das unidades das unidades. Talvez seja necessário concordar em verificar na próxima reinicialização para algumas unidades.
Alguns erros no disco são a causa mais provável.