Depende.
Se você estiver fechando uma sessão SSH, você está desconectado e todos os programas ativos são eliminados. Isso pode se tornar problemático se você tiver conexões freqüentes e, portanto, é recomendável usar o programa screen em uma sessão SSH se você não quiser perder sua sessão ao sair.
A maioria dos programas desaparece após uma conexão SSH fechada, se eles forem executados na linha de comando, por exemplo, nano ou apt-get . do-release-upgrade também usa screen e não será interrompido por uma queda de conexão.