Neste caso, nos registros, nenhuma notícia é uma boa notícia. Se houvesse erros que poderiam significar que o disco ou o sistema de arquivos estava indo mal.
Eu vi um relatório de bug sobre um programa "mais limpo" que gravaria milhares de arquivos, que fazia com que o Nautilus nunca "carregasse" a pasta, mas se não há muitos arquivos (procurando no terminal) não é isso ...
Talvez um arquivo corrompido estranho na pasta, Nautilus continua tentando ler para obter uma miniatura ou algo assim? Tente mover alguns arquivos para outro diretório, verifique se o Nautilus funciona em ambos, mova um pouco mais ... encontre o ruim? Ou veja se a pasta funciona sem arquivos?