Eu já lidei com isso antes. Parece haver uma diferença entre o plug-in Flash instalado no navegador e aquele que funciona melhor.
(Isso também parece resolver a questão de vídeos parando e se reiniciando espontaneamente no Firefox e no Chrome.)
Eu recomendo usar o Synaptic para verificar isso, mas as instruções abaixo são para o terminal ... já que você provavelmente não precisa de mim dizendo o que clicar no Synaptic, ha ha.
sudo apt-get remove flashplugin-installer
Isso remove a versão um pouco complicada que fica estacionada no navegador quando você instala a partir do site do Adobe Flash.
sudo apt-get install adobe-flashplugin
(Para o registro, essa é a versão 11. A versão 13 ainda não está disponível para o Firefox, como o user7134 afirmou corretamente.)
Isso instala o plug-in, o que funciona muito melhor. Esse é o único que eu instalei no meu sistema Ubuntu 14.14, e o Firefox e o Chrome estão muito felizes.