Eu enfrentei o mesmo problema ao substituir meu HDD (unidade de disco rígido) por SSD (unidade de estado sólido). As fontes começaram a aparecer como nas suas fotos! Eu resolvi isso desativando o login automático do usuário do Ubuntu em um sistema. Quando troco meu laptop, tenho que digitar a senha para ver a área de trabalho, mas as fontes e os temas estão parecendo corretos.