Um bookmark apropriado, pressionando Ctrl D ou outro meio de adicionar marcadores, criará uma entrada na seção Bookmarks do sidepane. Esta entrada irá lembrar o local em que você estava quando criou o marcador. A entrada na seção Rede é devido ao Nautilus lembrando o local e outras configurações de conexão para o servidor.
Aqui,aentradalab
naseção"Marcadores" é aberta no meu diretório ~/Downloads
, porque é onde eu a marcava como favorito.