O problema é que eu não estava configurando o ponto-e-vírgula final para o arquivo de configuração. Deve ficar assim:
Acquire::http::proxy "http://10.0.0.60:3128/";
Acquire::ftp::proxy "http://10.0.0.60:3128/";
Acquire::https::proxy "http://10.0.0.60:3128/";
Lendo a página do manual:
% bl0ck_qu0te%No caso de várias linhas usando escopos com freios cacheados , ele deve ser:
APT {
Get {
Assume-Yes "true";
Fix-Broken "true";
};
};