Você tem 2 fáceis de usar via terminal. Wondershaper e Trickle. Há mais aqui: Como limitar a velocidade da internet?
De qualquer forma, o básico é:
sudo apt-get install wondershaper
No terminal, descubra qual é o nome da interface conectada à sua internet usando ifconfig . Poderia ser eth0, eth1, eth2, etc ... No meu caso é eth1. Então, eu faria isso:
sudo wondershaper eth1 1024 256
Isso me dará uma velocidade de download de 1024 Kbits e 256 Kbits Upload. Quais são 128KB e 16KB.
Se você deseja redefinir isso, faça isso sudo wondershaper clear eth1
NOTA: Isso limitará QUALQUER COISA no seu PC, por exemplo, o torrent downloader, o firefox, etc.
Outro programa é o Trickle
Para instalar, faça isso:
sudo apt-get install trickle
Para usar use ifconfig para ver qual interface você está usando para internet e, em seguida:
sudo trickle -d 120 -u 32
São 120 KB de download e 32 KB de upload.
No meu caso, eu recomendo o Wondershaper.
Se você quiser mais informações para qualquer um dos dois após o tipo instalado man wondershaper ou man trickle dependendo do que você instalou.