O problema é um problema com o tema Ambiance. Há um destaque, mas a cor de fundo da pré-luz é mais escura. Se o thunderbird está mostrando um claro destaque e invertendo as cores dos ícones, é porque está usando widgets personalizados em XUL (que não é o Gtk +), que não seguem o GTK + ou os temas de ícones, para tudo.