Sim, é possível tornar todos os arquivos .jar no diretório atual em executáveis.
sudo find . -name "*.jar" -exec chmod +x {} \;
Se você quiser que chmod recursivamente (torna o executável mesmo se presente dentro de subdiretórios) faça todos os arquivos .jar como executáveis e então execute o comando abaixo.
sudo find . -name "*.jar" -exec chmod +x -R {} \;