Um dos problemas mais comuns com o cron é que ele é executado com um mínimo de shell e variáveis ambientais mínimas. Por isso, é melhor sempre usar o caminho completo para programas, binários, bibliotecas ou arquivos.
Além disso, embora você possa usar su, sudo é, IMO, uma ferramenta melhor. Especifique o usuário com o sinalizador -u.
Então, colocando tudo,
sudo -u ftpuser "screen -dmS /var/MC_SVR/McMyAdmin /var/MC_SVR/MCMA2_Linux_x86_64"