Você terá que recriar seu boot stick.
Eu testei isso usando o UNetBootin. Se você não o tiver instalado, terá que instalá-lo usando o Software Center (ou usando sudo apt-get install unetbootin
no terminal).
Na parte inferior da janela, você deve selecionar a quantidade de espaço usada para preservar as configurações e os arquivos durante as reinicializações (o padrão é 0). Defina este valor para o que mais lhe convier (dependendo também da capacidade do stick USB, é claro). Então, se tudo estiver definido, clique em OK para criar o disco.