Estou usando o MATLAB R2014a no Ubuntu 12.04.
Usar marcação tex como \ alpha, etc em objetos de texto renderiza caracteres ASCII regulares e não a saída esperada de tex.
Criar um link simbólico da pasta de fontes MATLAB para a pasta de fontes do sistema (conforme descrito aqui ) não ajuda.
O Google tem muitas soluções complicadas para problemas semelhantes, porém mais difíceis, com o suporte do MATLAB / LaTeX.
Como posso obter suporte a letra grega básica em objetos de texto?
Instalando algumas fontes X adicionais, conforme descrito aqui resolvido o problema com letras gregas e também tornou a fonte padrão uma fonte com melhor aparência do que a fonte monoespaçada que estava sendo usada antes.
sudo apt-get install xfonts-base xfonts-100dpi xfonts-75dpi
O xfonts-base já estava na versão mais recente, então acho que foram apenas os outros dois que fizeram a diferença. Lembre-se de sair e fazer login para tornar as alterações efetivas